Микробиом кишечника (метагеномное секвенирование 16S рРНК) в Москве

Микробиом кишечника представляет собой сложную экосистему, состоящую из триллионов микроорганизмов, включая бактерии, археи, вирусы и грибы. Эти микроорганизмы играют ключевую роль в поддержании здоровья хозяина через участие в процессах пищеварения, синтезе витаминов и иммунной регуляции. В последние годы изучение микробиома получило широкое распространение благодаря развитию технологий секвенирования. В клинике Global Project B&H определение Микробиома по нескольким методам - Микробиом кишечника и метагеномное секвенирование 16S рРНК - это один из них.

Метагеномное секвенирование 16S рРНК является одним из наиболее популярных методов изучения состава микробиоты. Этот метод основывается на амплификации и секвенировании гена 16S рибосомальной РНК, который присутствует у всех бактерий и позволяет различать их на уровне рода или даже вида. Метод 16S рРНК обеспечивает глубокое понимание таксономического состава микробиома, позволяя идентифицировать как доминирующие, так и разнообразные редкие бактериальные представители.

Показания для проведения анализа метагеномного секвенирования 16S рРНК могут быть весьма разнообразными:

• Диагностика заболеваний: Изменения в составе микробиоты связаны с рядом заболеваний, включая воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), синдром раздраженного кишечника (СРК), метаболические расстройства (например, ожирение и диабет), аутоиммунные состояния и даже определенные типы рака. Анализ микробиоты может помочь в диагностике или мониторинге таких заболеваний.
• Персонализированная медицина: Секвенирование может использоваться для разработки индивидуальных диет или терапий на основе уникального состава микробиома пациента.
• Исследовательская деятельность: Учеными анализируется влияние различных факторов окружающей среды (например, диета, антибиотики) на состав микробиома.
• Анализ эффективности вмешательств: После проведения терапевтических вмешательств (например, пробиотиков или трансплантации фекальной микробиоты) исследование может помочь оценить изменения в микробиоме.

Подготовка к проведению анализа метагеномного секвенирования требует соблюдения ряда рекомендаций:

• Диетические ограничения: За несколько дней до сбора образца рекомендуется избегать изменения привычного рациона питания и употребления пробиотиков или пребиотиков.
• Избегание приема антибиотиков: Антибиотики значительно влияют на состав микробиоты; поэтому рекомендуется воздержаться от их приема минимум за две недели до теста.
• Сбор образцов: Для исследования необходим образец кала. Важна стерильность при сборе материала во избежание контаминации посторонними микроорганизмами.
• Хранение образцов: После сбора образец следует надлежащим образом хранить — чаще всего замораживать — чтобы сохранить его состояние до анализа.
• Информация о подготовке может варьироваться в зависимости от лаборатории; важно следовать конкретным рекомендациям учреждения, проводящего тестирование.

Современные технологические достижения позволили значительно расширить знания о человеческом микробиоме и его влиянии на здоровье человека. Метагеномное секвенирование 16S рРНК предоставляет уникальные возможности для диагностики и персонализированного подхода к лечению различных заболеваний. Тем не менее интерпретация результатов этого анализа требует внимательного подхода со стороны специалистов для определения клинической значимости наблюдаемых изменений.

Нормы и отклонения:

• Позволяет определить содержание отдельных бактерий
• Выявляет колонии патогенных микроорганизмов, их концентрации и активности

Медицинская значимость:

• Позволяет определить резистентность к антибиотикам
• Выявляет биологический дисбаланса работы кишечника (дисбактериоз)

Результат исследования позволяет сформировать индивидуальные рекомендации по лечению заболеваний и профилактике старения:

• Разработка индивидуальных схем лечения на основе полученных данных
• Рекомендации по коррекции питания и изменению образа жизни для восстановления нормальной микрофлоры.